> Jak układ musi się komunikować ze światem zewnętrznym nie-optycznie i
> dodatkowo z zewnątrz zasilać, to i tak zakłócenia wlezą do środka.

No to do tego są specjalne metody do- i wyprowadzania sygnałów, oraz filtrowania
zasilania.
Ja właśnie robię projekt, gdzie AVR pracuje w mocno przemysłowym środowisku
(torowisko kolejowe,
zasilanie z przetwornicy, która jest zasilana z 1000V trakcji, itp itp) - i bez
stosowania
żadnego ekranowania, a tylko porządnie poodsprzęgane zasilania, i zero problemu.

Z erkanowaniem, i jakimiś dodatkowymi środkami bezpieczeństwa można AVR dać do
rakiety...
No i jak już wspomniałem - watchdog !