-
1. Data: 2022-10-19 21:29:04
Temat: Szukam aplikacji do analizy morfologicznej obrazów z mikroskopu
Od: a a <m...@g...com>
Na necie znalazlem aplikacje do analizy iobrazu komórek pod mikroskopem, do analizy
wymazu krwi, ale one pracują ze sprzętem,
a szukam aplikacji off-line, która zadziała z plikami graficznymi spod mikroskopu.
Może być na smartfona, może być wersja developerska , może działąc w chmurze, ale
cokolwiek szukam aby znaleźć, aby nie kupować razem z tym mikroskopu elektronowego
czy in nego.
-
2. Data: 2022-10-22 23:42:41
Temat: Re: Szukam aplikacji do analizy morfologicznej obrazów z mikroskopu
Od: Zenek Kapelinder <4...@g...com>
środa, 19 października 2022 o 21:29:05 UTC+2 m...@g...com napisał(a):
> Na necie znalazlem aplikacje do analizy iobrazu komórek pod mikroskopem, do analizy
wymazu krwi, ale one pracują ze sprzętem,
> a szukam aplikacji off-line, która zadziała z plikami graficznymi spod mikroskopu.
>
> Może być na smartfona, może być wersja developerska , może działąc w chmurze, ale
cokolwiek szukam aby znaleźć, aby nie kupować razem z tym mikroskopu elektronowego
czy in nego.
Jak znajdziesz to daj linka.
-
3. Data: 2022-10-23 19:28:46
Temat: Re: Szukam aplikacji do analizy morfologicznej obrazów z mikroskopu
Od: a a <m...@g...com>
On Saturday, 22 October 2022 at 23:42:42 UTC+2, Zenek Kapelinder wrote:
> środa, 19 października 2022 o 21:29:05 UTC+2 m...@g...com napisał(a):
> > Na necie znalazlem aplikacje do analizy iobrazu komórek pod mikroskopem, do
analizy wymazu krwi, ale one pracują ze sprzętem,
> > a szukam aplikacji off-line, która zadziała z plikami graficznymi spod
mikroskopu.
> >
> > Może być na smartfona, może być wersja developerska , może działąc w chmurze, ale
cokolwiek szukam aby znaleźć, aby nie kupować razem z tym mikroskopu elektronowego
czy in nego.
> Jak znajdziesz to daj linka.
---tutaj masz trochę linków do image processing
Czyli tych programów, aplikacji są setki
i dlatego organizuję międzynarodową konferencję
nt. Image Processing
Morphological Image Processing
aby zebrać i przetestować te wszystkie narzędzia w jednym miejscu i sprawdzić do
czego się nadają
i zebrać wszystkich praktyków, developerów,
aby każdy pokazał czym się zajmuje i jakie ma sukcesy i czego potrzebuje, czego
szuka.
Konferencja będzie organizowana w trybie on-line/ off-line, prezentacje na video,
pdf,
w formie Challengów, na wszystkich kontynentach,
w językach regionalnych, bo nie każdy lubi lub zna angielski
Kto chce może się przyłączyć, może znajdzie się jakiś budżet, sponsorzy
Przejrzę dotychczasowe konferencje nt. image processing, a głównie interesuje mnie
analiza morfologiczna w medycynie, biologii, astronomii, fizyce
Zacznę wydawać czasopisma Image Processing Journal, Morphological Image Processing
Journal, aby przyciągnąć zainteresowane osoby.
Do końca roku jeszcze 2 miesiące, czyli zdążymy oblecieć wszystkie kontynenty:
Azja, Ameryka, Europa, Australia, Afryka, Ameryka Południowa
Czyli to nie będzie jedna konferencja, a cykl konferencji typu Challenge, Tour jak
Iga w tenisie.
---AGAVE
AICSImageIO
Aydin
BIAFLOWS
BIII
BiofilmQ
Bio-Formats
BoneJ
BrainGlobe
Cellpose
CellProfiler
CLIJ
CytoMAP
Cytomine
DeepLabCut
Fiji
FLIMLib
GerBI
Icy
IDR
ilastik
ImageJ
ImageJ2
ImgLib2
ImJoy
JIPipe
Mars
MCMICRO
MIA
MIB
?Manager
MoBIE
MorphoGraphX
MorphoNet
napari
NEUBIAS
OME
OMERO
OmeSliCC
OpenIRIS
OpenSPIM
Orbit
Piximi
PYME
Python-Microscope
QuPath
SCIFIO
scikit-image
sciview
SR-Tesseler
StarDist
starfish
TissUUmaps
vedo
webKnossos
ZeroCostDL4Mic
-
4. Data: 2022-10-24 15:17:51
Temat: Re: Szukam aplikacji do analizy morfologicznej obrazów z mikroskopu
Od: Zenek Kapelinder <4...@g...com>
niedziela, 23 października 2022 o 19:28:47 UTC+2 m...@g...com napisał(a):
> On Saturday, 22 October 2022 at 23:42:42 UTC+2, Zenek Kapelinder wrote:
> > środa, 19 października 2022 o 21:29:05 UTC+2 m...@g...com napisał(a):
> > > Na necie znalazlem aplikacje do analizy iobrazu komórek pod mikroskopem, do
analizy wymazu krwi, ale one pracują ze sprzętem,
> > > a szukam aplikacji off-line, która zadziała z plikami graficznymi spod
mikroskopu.
> > >
> > > Może być na smartfona, może być wersja developerska , może działąc w chmurze,
ale cokolwiek szukam aby znaleźć, aby nie kupować razem z tym mikroskopu
elektronowego czy in nego.
> > Jak znajdziesz to daj linka.
> ---tutaj masz trochę linków do image processing
>
> Czyli tych programów, aplikacji są setki
> i dlatego organizuję międzynarodową konferencję
> nt. Image Processing
> Morphological Image Processing
>
> aby zebrać i przetestować te wszystkie narzędzia w jednym miejscu i sprawdzić do
czego się nadają
> i zebrać wszystkich praktyków, developerów,
> aby każdy pokazał czym się zajmuje i jakie ma sukcesy i czego potrzebuje, czego
szuka.
>
> Konferencja będzie organizowana w trybie on-line/ off-line, prezentacje na video,
pdf,
> w formie Challengów, na wszystkich kontynentach,
> w językach regionalnych, bo nie każdy lubi lub zna angielski
>
> Kto chce może się przyłączyć, może znajdzie się jakiś budżet, sponsorzy
>
> Przejrzę dotychczasowe konferencje nt. image processing, a głównie interesuje mnie
analiza morfologiczna w medycynie, biologii, astronomii, fizyce
>
> Zacznę wydawać czasopisma Image Processing Journal, Morphological Image Processing
Journal, aby przyciągnąć zainteresowane osoby.
>
> Do końca roku jeszcze 2 miesiące, czyli zdążymy oblecieć wszystkie kontynenty:
>
> Azja, Ameryka, Europa, Australia, Afryka, Ameryka Południowa
>
> Czyli to nie będzie jedna konferencja, a cykl konferencji typu Challenge, Tour jak
Iga w tenisie.
> ---AGAVE
> AICSImageIO
> Aydin
> BIAFLOWS
> BIII
> BiofilmQ
> Bio-Formats
> BoneJ
> BrainGlobe
> Cellpose
> CellProfiler
> CLIJ
> CytoMAP
> Cytomine
> DeepLabCut
> Fiji
> FLIMLib
> GerBI
> Icy
> IDR
> ilastik
> ImageJ
> ImageJ2
> ImgLib2
> ImJoy
> JIPipe
> Mars
> MCMICRO
> MIA
> MIB
> ?Manager
> MoBIE
> MorphoGraphX
> MorphoNet
> napari
> NEUBIAS
> OME
> OMERO
> OmeSliCC
> OpenIRIS
> OpenSPIM
> Orbit
> Piximi
> PYME
> Python-Microscope
> QuPath
> SCIFIO
> scikit-image
> sciview
> SR-Tesseler
> StarDist
> starfish
> TissUUmaps
> vedo
> webKnossos
> ZeroCostDL4Mic
Po chuj pytasz i prąd marnujesz jak masz tyle co napisałeś?
-
5. Data: 2022-10-24 19:13:54
Temat: Re: Szukam aplikacji do analizy morfologicznej obrazów z mikroskopu
Od: a a <m...@g...com>
On Monday, 24 October 2022 at 15:17:52 UTC+2, Zenek Kapelinder wrote:
> niedziela, 23 października 2022 o 19:28:47 UTC+2 m...@g...com napisał(a):
> > On Saturday, 22 October 2022 at 23:42:42 UTC+2, Zenek Kapelinder wrote:
> > > środa, 19 października 2022 o 21:29:05 UTC+2 m...@g...com napisał(a):
> > > > Na necie znalazlem aplikacje do analizy iobrazu komórek pod mikroskopem, do
analizy wymazu krwi, ale one pracują ze sprzętem,
> > > > a szukam aplikacji off-line, która zadziała z plikami graficznymi spod
mikroskopu.
> > > >
> > > > Może być na smartfona, może być wersja developerska , może działąc w chmurze,
ale cokolwiek szukam aby znaleźć, aby nie kupować razem z tym mikroskopu
elektronowego czy in nego.
> > > Jak znajdziesz to daj linka.
> > ---tutaj masz trochę linków do image processing
> >
> > Czyli tych programów, aplikacji są setki
> > i dlatego organizuję międzynarodową konferencję
> > nt. Image Processing
> > Morphological Image Processing
> >
> > aby zebrać i przetestować te wszystkie narzędzia w jednym miejscu i sprawdzić do
czego się nadają
> > i zebrać wszystkich praktyków, developerów,
> > aby każdy pokazał czym się zajmuje i jakie ma sukcesy i czego potrzebuje, czego
szuka.
> >
> > Konferencja będzie organizowana w trybie on-line/ off-line, prezentacje na video,
pdf,
> > w formie Challengów, na wszystkich kontynentach,
> > w językach regionalnych, bo nie każdy lubi lub zna angielski
> >
> > Kto chce może się przyłączyć, może znajdzie się jakiś budżet, sponsorzy
> >
> > Przejrzę dotychczasowe konferencje nt. image processing, a głównie interesuje
mnie analiza morfologiczna w medycynie, biologii, astronomii, fizyce
> >
> > Zacznę wydawać czasopisma Image Processing Journal, Morphological Image
Processing Journal, aby przyciągnąć zainteresowane osoby.
> >
> > Do końca roku jeszcze 2 miesiące, czyli zdążymy oblecieć wszystkie kontynenty:
> >
> > Azja, Ameryka, Europa, Australia, Afryka, Ameryka Południowa
> >
> > Czyli to nie będzie jedna konferencja, a cykl konferencji typu Challenge, Tour
jak Iga w tenisie.
> > ---AGAVE
> > AICSImageIO
> > Aydin
> > BIAFLOWS
> > BIII
> > BiofilmQ
> > Bio-Formats
> > BoneJ
> > BrainGlobe
> > Cellpose
> > CellProfiler
> > CLIJ
> > CytoMAP
> > Cytomine
> > DeepLabCut
> > Fiji
> > FLIMLib
> > GerBI
> > Icy
> > IDR
> > ilastik
> > ImageJ
> > ImageJ2
> > ImgLib2
> > ImJoy
> > JIPipe
> > Mars
> > MCMICRO
> > MIA
> > MIB
> > ?Manager
> > MoBIE
> > MorphoGraphX
> > MorphoNet
> > napari
> > NEUBIAS
> > OME
> > OMERO
> > OmeSliCC
> > OpenIRIS
> > OpenSPIM
> > Orbit
> > Piximi
> > PYME
> > Python-Microscope
> > QuPath
> > SCIFIO
> > scikit-image
> > sciview
> > SR-Tesseler
> > StarDist
> > starfish
> > TissUUmaps
> > vedo
> > webKnossos
> > ZeroCostDL4Mic
To masz to jedynie tekst do przeczytania
a potem 50 aplikacji do ściągnięcia, zainstalowania, przetestowania opcji.,
Wczoraj sprawdzałem na
stackoverflow
i jest 1000 linków nt. przetwarzania obrazów
i 500 nt. morfologicznego przetwarzania
Niektóre aplikacje mają po 30 lat, pisane pod DOS, Linuxa, sponsorowane przez
US Department of Health
są nowsze wersje i instalują sie live, w przeglądarce, a potem są do nich pluginy,
np. do Pythona
i jest ich kilkanaście, kilkadziesiąt.
A potem jest grupa użytkowników Mathematica, Matlab
i znów 100 linków
a potem sa filtry pisane w JavaScript pod HTML5 i znów kilkadziesiąt linków.
Nie mówiąc już o linkach z wyszukiwarek.
A potem jest Azja, Chiny i oini maja bardzo zaawansowane technologie przetwarzania
obrazow, rozpoznawania twarzy, wykrywania temperatury pasażerów lotniska, metra, live
i on-line i wielu osób naraz, aby wykryć covida.
I testowalem te kamery, ale maja soft wbudowany (embedded).
Zatem warto zorganizować konferencję, aby praktycy, siedzący w temacie 5-10-20 lat
wypowiedzieli się co jest możliwe, co jest oferowane a nad czym nadal; pracują
developerzy, naukowcy na świecie.
Usenet jest ok, bo bez reklam i mozna nowe grupy zakladać, ale Usenet nie przyciągnie
użytkowników.
Facebook się nie nadaje, ani Twitter do dyskusji.
Sprawdzałem wczoraj w Szwajcarii i można były wydawac czasopisma on-line , a teraz za
wszystko chca kasy,
a wszystkie archiwa, dotychczasowe journals pokasowali.
Covid nadal w wielu krajach, na kontynentach i restrykcje, kasy brak, ludzie
podróżować nie chcą.
Czyli forma on-line bedzie ok, ale gdzies trzeba zarchiwizować materiały, referaty,
dyskusja,
bo wyszukiwarki internetowe sa komercyjne i preferują handlarzy, co placą za reklamy
swoich towarów
i one lądują na początku.
Książkę mozna napisać, ale nikt nie kupi, musi byc on-line i za frico.
\
Chinczyk zrobił obrazowanie 3D do tomografii komputerowej do natychmiastowego
wykrywania covida i żałuję, że tego nie kupiłem, bo to była obrazowa nowość.
Czyli do zbudowania bazy wiedzy
State-of-the-art in Image Processing (Medicine, Biology, Astronomy, Physics ...)
trzeba przejrzeć milion linków
Dziennie mogę przejrzeć 100 a nawet kilkaset, ale na milion rok zleci i dłużej.
Zatem jednak konferencja on-line i to Global Conference on Image Processing
bo tylko ta drogą mozna przycciągnąć tych najlepszych, aby się podzielili swoją
wiedza, osiągnięciami
i pokazali, gdzie są granice obecnego stanu wiedzy w zakresie przetwarzania obrazów (
morfologicznego przetwarzania).
Czytałem o koncepcjach odtwarzania scen 3D z 1 płaskiego obrazu i odtwarzania bryl 3D
obiektów ze zdjęcia 2D.
Ale do tego potrzebne są biblioteki obiektów i biblioteki rzutowania 3D na 2D,
rzutowania ze sfery na 2D
Interesująca jest praca nt. odzyskiwania tekstów z rozmytego obrazu przez ruch
kamery.
Zatem pracy jest dużo, a czasu mało
i nawet Zenek się przyda, aby coś posprzatal, pozamiatal, talerze pozmywał po
uczestnikach konferencji.
Gdyby nie resztki covida to bym wprowadził koncepcję Shibuya University z Tokio,
czyli tam nauka, tam konferencja , gdzie się spotkamy
Albo warsztaty typu MIT, albo Technology and Innovation Parks Boston, Sydney,
Pasadena
Co będzie to będzie, ale to i tak lepsze niż pocovidowe nic, marazm, depresja, krach
gospodarczy, recesja i alkoholizm.